Материалы и методы
Страница 2

) трис-ЭДТА-боратная, рН 8.6; В

) трис-цитрат, рН 6.2. Все параметры электрофоретического фракционирования, а также экстракция и гистохимическое выявление ферментов подробно приведены нами ранее (Гончаренко и др., 1984; Гончаренко, 1987; Goncharenko et al., 1985). Название ферментов, их кодовый номер, предпочитаемая для анализа буферная система, а также количество используемых локусов приведены в табл.1. Каждая муха была исследована по 15 генам, кодирующим 11 ферментов (табл.1.). Обозначение выявленных электрофоретических вариантов дано по общепринятой номенклатуре Пракаша с соавторами (Prakash et al., 1969), в соответствии с которой наиболее часто встречающийся электроморф по каждому локусу у D. virilis и кодирующий его аллель обозначались символом 1.00, а все другие аллельные варианты, встреченные у проанализированных нами видов Drosophila группы virilis обозначены цифровыми символами в зависимости от их электрофоретической подвижности относительно 1.00. Нулевые аллели обозначены символом 0.

Таблица 1

. Ферменты и количество локусов, использованные для анализа видов-двойников Drosophila группы virilis Палеарктики

Фермент

Аббревиатура

Буферная система

Кодовый номер

Количество локусов

Алкогольдегидрогеназа

ADH

А

1.1.1.1.

1

Гексокиназа

HK

А

2.7.1.1.

2

Изоцитратдегидрогеназа

IDH

В

1.1.1.42.

1

Кислая фосфатаза

ACPH

А

3.1.3.2.

1

Малатдегидрогеназа

MDH

В

1.1.1.37.

2

Малик

ME

А

1.1.1.40

1

Октанолдегидрогеназа

ODH

А

1.1.1.1.

1

Фосфоглюкомутаза

PGM

А

2.7.5.1.

1

Эстераза

EST

А

3.1.1.1.

3

Фумараза

FUM

А

4.2.1.2.

1

α-Глицерофосфатдегидрогеназа

GPDH

В

1.1.1.8.

1

Для оценки генетической близости и дифференциации

среди представителей Drosophila группы virilis использовался коэффициент генетической дистанции Неи, DN (Nei, 1972), который учитывает различия в аллельных частотах всех проанализированных локусов:

DN= – ln IN ,

где xij и yij — частоты i-того аллеля j-того локуса сравниваемых таксонов.

Если DN равно 0, то таксоны идентичны. Чем больше значение DN, тем менее они родственны. Считается, что коэффициент дистанции Неи дает наиболее точные оценки генетической дифференциации, и поэтому он широко используется практически всеми исследователями. Дендрограмма отражающая картину генетических взаимоотношений между исследованными видами Drosophila группы virilis на основании коэффициентов DN была построена путем невзвешенного парногруппового метода кластерного анализа

(UPGMA)

(Sneath, Sokal, 1973).

Еще одним достоинством коэффициента генетической дистанции Неи (DN) является то, что он позволяет рассчитывать время дивергенции (t)таксонов различного ранга исходя из следующего соотношения:

где с – доля аминокислотных замещений, которая может быть определена посредством электрофореза, n – общее количество кодонов, связанных с синтезом полипептида, и λ – средняя скорость аминокислотных замещений (Nei, 1971). Согласно Неи (1971), t = 7.4 ´ 105DN. Имеется также другая оценка временной шкалы, предложенная Неи в более поздней работе, где t = 5 ´ 106DN (Nei, 1975).

Страницы: 1 2 3


Рекомендуем к прочтению:

Класс Аскомицеты, или сумчатые грибы Ascomycetes. Общие сведения
Аскомицеты, или сумчатые грибы – один из обширнейших классов грибов, включающих 30 000 видов, разнообразных по строению, та и по образу жизни. Основные признаки аскомицетов формирование в результате полового процесса сумок, или асков,- з ...

Введение.
Ретинальсодержащий белок - бактериородопсин, выполняющий функции АТФ-зависимой транслоказы в клеточной мембране галофильных бактерий Halobacterium halobium , был выделен и детально проанализирован Остерхельтом в 1970 году [1]. Несмотря на ...

Сциентизм и антисциентизм – мировоззренческие позиции ХХ века и их влияние на развитие культуры
В разные исторические эпохи в качестве основания культуры, ее ведущего духовного компонента, выступали разные духовные формы: в античности – политика и мораль; в средневековье – религия; в эпоху Возрождения – искусство; в новое время – на ...