Материалы и методы
Страница 2

) трис-ЭДТА-боратная, рН 8.6; В

) трис-цитрат, рН 6.2. Все параметры электрофоретического фракционирования, а также экстракция и гистохимическое выявление ферментов подробно приведены нами ранее (Гончаренко и др., 1984; Гончаренко, 1987; Goncharenko et al., 1985). Название ферментов, их кодовый номер, предпочитаемая для анализа буферная система, а также количество используемых локусов приведены в табл.1. Каждая муха была исследована по 15 генам, кодирующим 11 ферментов (табл.1.). Обозначение выявленных электрофоретических вариантов дано по общепринятой номенклатуре Пракаша с соавторами (Prakash et al., 1969), в соответствии с которой наиболее часто встречающийся электроморф по каждому локусу у D. virilis и кодирующий его аллель обозначались символом 1.00, а все другие аллельные варианты, встреченные у проанализированных нами видов Drosophila группы virilis обозначены цифровыми символами в зависимости от их электрофоретической подвижности относительно 1.00. Нулевые аллели обозначены символом 0.

Таблица 1

. Ферменты и количество локусов, использованные для анализа видов-двойников Drosophila группы virilis Палеарктики

Фермент

Аббревиатура

Буферная система

Кодовый номер

Количество локусов

Алкогольдегидрогеназа

ADH

А

1.1.1.1.

1

Гексокиназа

HK

А

2.7.1.1.

2

Изоцитратдегидрогеназа

IDH

В

1.1.1.42.

1

Кислая фосфатаза

ACPH

А

3.1.3.2.

1

Малатдегидрогеназа

MDH

В

1.1.1.37.

2

Малик

ME

А

1.1.1.40

1

Октанолдегидрогеназа

ODH

А

1.1.1.1.

1

Фосфоглюкомутаза

PGM

А

2.7.5.1.

1

Эстераза

EST

А

3.1.1.1.

3

Фумараза

FUM

А

4.2.1.2.

1

α-Глицерофосфатдегидрогеназа

GPDH

В

1.1.1.8.

1

Для оценки генетической близости и дифференциации

среди представителей Drosophila группы virilis использовался коэффициент генетической дистанции Неи, DN (Nei, 1972), который учитывает различия в аллельных частотах всех проанализированных локусов:

DN= – ln IN ,

где xij и yij — частоты i-того аллеля j-того локуса сравниваемых таксонов.

Если DN равно 0, то таксоны идентичны. Чем больше значение DN, тем менее они родственны. Считается, что коэффициент дистанции Неи дает наиболее точные оценки генетической дифференциации, и поэтому он широко используется практически всеми исследователями. Дендрограмма отражающая картину генетических взаимоотношений между исследованными видами Drosophila группы virilis на основании коэффициентов DN была построена путем невзвешенного парногруппового метода кластерного анализа

(UPGMA)

(Sneath, Sokal, 1973).

Еще одним достоинством коэффициента генетической дистанции Неи (DN) является то, что он позволяет рассчитывать время дивергенции (t)таксонов различного ранга исходя из следующего соотношения:

где с – доля аминокислотных замещений, которая может быть определена посредством электрофореза, n – общее количество кодонов, связанных с синтезом полипептида, и λ – средняя скорость аминокислотных замещений (Nei, 1971). Согласно Неи (1971), t = 7.4 ´ 105DN. Имеется также другая оценка временной шкалы, предложенная Неи в более поздней работе, где t = 5 ´ 106DN (Nei, 1975).

Страницы: 1 2 3


Рекомендуем к прочтению:

Теория электромагнитного поля. Вещество и поле.
На практике при характеристике электромагнитной обстановки используют термины "электрическое поле", "магнитное поле", "электромагнитное поле". Коротко поясним, что это означает и какая связь существует между ...

Семейство Бобровые (Castoridae)
Бобровые крупные грызуны. Тело их массивное, хвост уплощенный сверху вниз и покрытый большими роговыми щитками. Пальцы задних ног соединены плавательной перепонкой, а передние свободны. Коготь второго пальца задних конечностей раздвоен, о ...

Задачи ботанических садов
" Ботанические сады являются научно-исследовательскими учреждениями, изучающими растения и растительность с целью управления жизнью растений и создания новых форм, наиболее удовлетворяющих запросы человека. Важнейшее звено в работе б ...